La presencia de los Hermanos de las Escuelas Cristianas en Cantabria comienza con la fundación en 1881 de una escuela en la localidad de Isla, a la que pronto siguieron varios centros más en otras poblaciones de la Montaña, como Cóbreces (1882), Castro Urdiales y Anaz (1884), Terán-Cabuérniga (1887) y Los Corrales de Buelna (1890). Ya en el s. XX funcionaron además las escuelas de Riotuerto (1917) y Santoña (1920).
Hubo que esperar hasta 1901 para que llegasen a Santander, cuando el jesuita Padre Mendía llamó a los Hermanos para que se hiciesen cargo del Colegio del "Círculo Católico de Obreros", que estaba situado en la calle San José. Tan grande fue su éxito que hubo que abrir más aulas en otro local cercano, en la calle Pedrueca, en 1903. Por sus aulas pasaron unos siete mil alumnos hasta 1940, año en el que, por el deterioro de las instalaciones, fue cerrado.
Fue entonces cuando, con la colaboración de algunos particulares, los Hermanos de La Salle adquirieron la "Quinta Hoppe", una finca situada en General Dávila 109, y que era propiedad de un cónsul alemán en España. El chalet serviría, a partir del otoño de aquel año, como vivienda a los ocho Hermanos y de Colegio, con sesenta alumnos. Al año siguiente eran ya ciento ochenta y, al tercer año, más de trescientos. Durante estos tres cursos el Colegio estuvo bajo la dirección del Hermano Luciano Paciente.
En 1943 se inició la construcción del actual edificio del Colegio, en el jardín y zona de arbolado de la finca. Al inaugurarse contaba ya con seiscientos alumnos externos y más de un centenar de internos que se distribuían en tres secciones: Primaria, Bachillerato y enseñanza Comercial.
Desde su fundación, el Colegio «La Salle» se ha esforzado por adaptarse a los tiempos y a las nuevas necesidades de los jóvenes. Ya desde un principio los Antiguos Alumnos han jugado un papel importantísimo, lo que denota su vinculación y aprecio al Colegio; con el deseo de hacer algo por los más necesitados de la ciudad, en 1962 abrieron el Colegio de Antiguos Alumnos de La Salle en el Barrio Pesquero. Poco antes los Hermanos habían abierto dos obras más en la capital santanderina: en la Obra Social San Martín (1945-1967) y en la zona de Nueva Montaña (1957-1962).
Durante los últimos años se han producido distintos cambios: la primera alumna entró en el Colegio en el curso 75-76; en 1986 se reestructuraron algunos locales, con la modificación de la antigua capilla por otra más moderna y funcional; y en 1987 se inauguró el actual polideportivo... En la actualidad se están aplicando los nuevos métodos y orientaciones de la Reforma Educativa de la LOGSE. En este momento cuenta con un total de 983 alumnos, 50 profesores y una Comunidad compuesta por 10 Hermanos. Tiene 6 aulas de Infantil, 12 de Primaria, 13 de Secundaria y 6 de Bachillerato, de las modalidades Ciencias de la Naturaleza, Humanidades y Tecnológico. Desde el curso 2003 a 2007, un seglar, D. Abdón González Cembellín asume tarea de animar el Centro en el espíritu de la Misión Compartida, en la que Hermanos y Seglares llevan a cabo un mismo proyecto común: hacer presente el carisma de La Salle en Santander. Desde el 2008, el H. José Ramón Palma dirige el colegio. Desde su fundación en 1940, el Colegio ha tenido más de 12.000 alumnos y 17 directores.
La labor de los Hermanos continúa presente hoy en Cantabria en el Colegio «San Juan Bautista» de Los Corrales de Buelna.